総合医薬学研究科は、医学、薬学及び看護学を総合した特色ある教育と研究を礎とし、幅広い知識を基盤とする高い専門性と人間尊重の精神を基本とする豊かな創造力を培い、学術研究の進歩や社会に積極的に貢献できる総合的な判断力を有する高度医療専門職業人又は教育研究者としての人材を育成することを目的としています。
また総合医薬学研究科は、医学?薬学?看護学分野における基盤的研究の深化とこれら分野間の連携?融合の更なる強化を図り、医学?薬学?看護分野の枠組みを超えて協同するため、医学?薬学?看護学分野を包括する総合医薬学専攻を１専攻として組織し、専?分野（医科学、看護学、薬科学）ごとに学位プログラムを設けます。
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課程?専攻、取得できる学位
| 課程 | 専攻 | プログラム | 取得できる学位 |
|---|---|---|---|
| 修士課程 | 総合医薬学専攻 | 先端医科学プログラム | 修士（医科学） |
| 博士前期課程 | 看護科学プログラム | 修士（看護学） | |
| 先端薬科学プログラム | 修士（薬科学） | ||
| 博士後期課程 | 総合医薬学専攻 | 看護科学プログラム | 博士（看護学） |
| 先端薬科学プログラム | 博士（薬科学） | ||
| 一貫制博士課程 | 生命?臨床医学プログラム | 博士（医学） | |
| 臨床薬学プログラム | 博士（薬学） |